Την απαλλαγή των τριών αξιωματικών της ΕΛ.ΑΣ. πρότεινε ο Εισαγγελέας, στη δίκη που αφορά τη διερεύνηση των ευθυνών για τον σχεδιασμό, την οργάνωση και την υλοποίησή της επιχείρησης στα Ζωνιανά τον Νοέμβριο του 2007.
Κατά την ακροαματική διαδικασία δεν προέκυψε το αδίκημα της παράβασης καθήκοντος. Σύμφωνα με την εισαγγελική αγόρευση, το αδίκημα που προέκυψε είναι αυτό της έκθεσης σε κίνδυνο θανάτωσης 49 ατόμων, ωστόσο από το νόμο δεν προβλέπεται η μετατροπή της κατηγορίας.
Ειδικότερα, ο Εισαγγελέας αναγνώρισε ότι την ευθύνη για τον κακό σχεδιασμό, τις παραλείψεις και την μη επίβλεψη της επιχείρησης στα Ζωνιανά είχε ο πρώην Γενικός Αστυνομικός Διευθυντής Περιφέρειας Κρήτης, Αντώνης Βιτωράκης.
Σύμφωνα με το κατηγορητήριο, ο Α.Βιτωράκης και οι δυο Ρεθυμνιώτες αστυνομικοί, στους οποίους έδωσε εντολή να γίνει η επιχείρηση, προκειμένου να πραγματοποιηθεί έρευνα στο σπίτι νεαρού που είχε συλληφθεί στο Φόδελε για κατοχή και διακίνηση ηρωίνης, κατόπιν σήματος που είχε στείλει η Υποδιεύθυνση Ασφαλείας Ηρακλείου, στους συναδέλφους τους του Ρεθύμνου, διώκονται για παράβαση καθήκοντος, καθώς φέρονται να μην σχεδίασαν με τη δέουσα προσοχή την επιχείρηση, δεν έλαβαν όλα τα μέτρα που είχαν υποχρέωση, ώστε να μην κινδυνεύσουν οι ζωές των αστυνομικών. Κατηγορούνται για προχειρότητα, λάθη και παραλείψεις.
Ο δε κ. Βιτωράκης κατηγορείται επιπλέον ότι την προηγούμενη της επιχείρησης, μετέβη στα Ζωνιανά, ενημέρωσε παράγοντες του χωριού για την επιχείρηση και έκανε συνεννόηση μαζί τους να αφήσουν την αστυνομική δύναμη να περάσει ανεμπόδιστα στο χωριό.
Υπενθυμίζεται ότι κατά τη διάρκεια της επιχείρησης κι ενώ οι αστυνομικοί κατευθύνονταν στα Ζωνιανά, βρισκόμενοι κοντά στην είσοδο του χωριού δέχτηκαν ένοπλη επίθεση από κατοίκους του χωριού, με αποτέλεσμα από τις βολές των καλάσνικοφ να τραυματιστεί βαρύτατα ο ειδικός φρουρός Στάθης Λαζαρίδης, που ακόμα βρίσκεται στο Νοσοκομείο σε κωματώδη κατάσταση, να τραυματιστούν δυο ακόμα ειδικοί φρουροί από σφαίρες που δέχτηκε το τζιπ στο οποίο επέβαιναν και να κινδυνεύει η ζωή όλων ανεξαιρέτως των αστυνομικών που συμμετείχαν στην επιχείρηση και της δικαστικού που τους συνόδευε για να εποπτεύει την έρευνα.
