Η «Γαλάζια Σημαία» αποτελεί διεθνώς αναγνωρισμένο περιβαλλοντολογικό πρόγραμμα, που θεσπίζεται από την Ελληνική Εταιρία Προστασίας της Φύσης, την παλαιότερη περιβαλλοντολογική οργάνωση της χώρας.
Στο πλαίσιο της διάκρισης του Aquila Porto Rethymno, διοργανώθηκε στις 19 Ιουνίου 2013, τελετή και έπαρση της Γαλάζιας Σημαίας, παρουσία της Διεύθυνσης, του προσωπικού αλλά και με τη συμμετοχή των επαναλαμβανόμενων πελατών του ξενοδοχείου στις εκδηλώσεις που πραγματοποιήθηκαν καθ’ όλη την διάρκεια της ημέρας.
Την πολιτική περιβαλλοντικής διαχείρισης που έχει αναπτυχτεί στον όμιλο Aquila Hotels & Resorts, ακολουθεί έμπρακτα το ξενοδοχείο Porto Rethymno συμμετέχοντας στις περιβαλλοντολογικές καμπάνιες «Clean Up the Med» και «MEDSOS, Καθαρίστε τη Μεσόγειο». Μαθητές, του 6ου και 14ου Δημοτικού Σχολείου Ρεθύμνου, μέλη του Συλλόγου για την Προστασία της Θαλάσσιας Χελώνας «Αρχέλων», καθώς και πελάτες του ξενοδοχείου, συμμετείχαν σε συμβολικούς καθαρισμούς της ακτής και σε άλλες δραστηριότητες που έλαβαν χώρα, μεταξύ των οποίων ζωντανή αναπαράσταση ωοτοκίας της θαλάσσιας χελώνας, παιχνίδια στην παραλία, παρουσίαση με slides κτλ.
Οι παραπάνω ενέργειες ολοκληρώθηκαν με παράθεση μπουφέ βιολογικών και παραδοσιακών εδεσμάτων προς τους συμμετέχοντες.