Με το σύστημα διεξαγωγής να επιστρέφει στα πρότυπα του προ εξαετίας μοντέλου των ομίλων στην Α’ φάση του, πραγματοποιήθηκε στην Αγία Γαλήνη η κλήρωση του Κυπέλλου ερασιτεχνών του Ρεθύμνου, με τους επικεφαλής των τριών τελευταίων γκρουπ Αστέρα Ρεθύμνου, Ρεθυμνιακό και Επισκοπή να νιώθουν πιο σίγουροι για την επόμενη φάση και την περίπτωση των δυο πρώτων ομίλων να μοιάζει πιο περίπλοκη για την συνέχεια.
Άτυχη της κλήρωσης η Αλφά, που ξεκινάει με φιλοξενία από Ερμή Ζωνιανών και Ασή Γωνιά στις πρώτες 2 αγωνιστικές του πρωταθλήματος, ενώ στη συνέχεια πέφτει πάνω στον Ρεθυμνιακό.
Οι όμιλοι όπως εκείνοι καταρτίστηκαν και οι 3 αγωνιστικές τους:
Α’ Όμιλος
Ερμής Ζωνιανών, Γεράκια Γερανίου Φωκά, ΟΦ Αρμένων, Άρης Ρεθύμνου
1η Αγωνιστική
Γεράκια Γερανίου – ΟΦ Αρμένων
Άρης Ρεθύμνου – Ερμής Ζωνιανών
2η Αγωνιστική
Ερμής Ζωνιανών – Γεράκια Γερανίου
ΟΦ Αρμένων – Άρης Ρεθύμνου
3η Αγωνιστική
ΟΦ Αρμένων – Ερμής Ζωνιανών
Γεράκια Γερανίου – Άρης Ρεθύμνου
Β’ Όμιλος
Τάλως Μελιδονίου, Μέλαμπες, Επισκοπή 2010, Ποσειδώνας Γερανίου
1η Αγωνιστική
Μέλαμπες – Επισκοπή 2010
Ποσειδώνας Γερανίου – Τάλως Μελιδονίου
2η Αγωνιστική
Τάλως Μελιδονίου – Μέλαμπες
Επισκοπή 2010 – Ποσειδώνας Γερανίου
3η Αγωνιστική
Επισκοπή 2010 – Τάλως Μελιδονίου
Μέλαμπες – Ποσειδώνας Γερανίου
Γ’ Όμιλος
Αστέρας Ρεθύμνου, Σπήλι, Ασή Γωνιά, Ψηλορείτης
1η Αγωνιστική
Σπήλι – Ασή Γωνιά
Ψηλορείτης – Αστέρας Ρεθύμνου
2η Αγωνιστική
Αστέρας Ρεθύμνου – Σπήλι
Ασή Γωνιά – Ψηλορείτης
3η Αγωνιστική
Ασή Γωνιά – Αστέρας Ρεθύμνου
Σπήλι – Ψηλορείτης
Δ’ Όμιλος
Ρεθυμνιακός, Αρκάδι Αγγελιανών, ΠΑΟ Αλφάς, ΕΑΠ
1η Αγωνιστική
Αρκάδι Αγγελιανών – ΠΑΟ Αλφάς
ΕΑΠ – Ρεθυμνιακός
2η Αγωνιστική
Ρεθυμνιακός – Αρκάδι Αγγελιανών
ΠΑΟ Αλφάς – ΕΑΠ
3η Αγωνιστική
ΠΑΟ Αλφάς – Ρεθυμνιακός
Αρκάδι Αγγελιανών – ΕΑΠ
Ε’ Όμιλος
Επισκοπή, Λιβάδια, Δόξα Πλατανέ, Αστέρας Περάματος
1η Αγωνιστική
Λιβάδια – Δόξα Πλατανέ
Αστέρας Περάματος – Επισκοπή
2η Αγωνιστική
Επισκοπή – Λιβάδια
Δόξα Πλατανέ – Αστέρας Περάματος
3η αγωνιστική
Δόξα Πλατανέ – Επισκοπή
Λιβάδια – Αστέρας Περάματος
Οι αγώνες της Α’ φάσης των ομίλων θα πραγματοποιηθούν βάση του προγράμματος
1η Αγωνιστική 14-15/9
2η Αγωνιστική 21-22/9
3η Αγωνιστική 28-29/9
Β’ Φάση
Β1 2ος του Α’ ομίλου-2ος του Β’ Ομίλου
Β2 2ος του Γ’ Ομίλου – 2ος του Δ’ Ομίλου
Γ’ Φάση
Γ1 1ος του Α’ Ομίλου- Β1
Γ2 1ος του Β’ Ομίλου – Β2
Γ3 1ος του Γ’ Ομίλου – 2ος του Ε’ Ομίλου
Γ4 1ος του Δ’ Ομίλου – 1ος του Ε’ Ομίλου
Δ’ Φάση (Ημιτελικοί)
Δ1 Γ1-Γ2
Δ2 Γ3-Γ4
Ε’ Φάση (Τελικός)
Ε1 Δ1-Δ2