Σύμφωνα με το εορταστικό πρόγραμμα του Ενυδρείου Κρήτης, οι εορταστικές του δραστηριότητες κορυφώνονται την ημέρα των Θεοφανίων, Παρασκευή 6 Ιανουαρίου και ώρα 13:00 περίπου, με την τελετή του Αγιασμού των υδάτων από τον Σεβασμιότατο Αρχιεπίσκοπο Κρήτης κ.κ. Ευγένιο.
Όπως αναφέρεται σε ενημερωτικό σημείωμα της Διεύθυνσης του Ενυδρείου Κρήτης: «Την τελετή θα μπορούν να την παρακολουθήσουν οι επισκέπτες μπροστά από την πανοραμική δεξαμενή, ενώ ταυτόχρονα θα προβάλλεται σε διάφορες οθόνες στο χώρο του Ενυδρείου.
Τονίζουμε, ότι για λόγους ασφαλείας θα τηρηθεί αυστηρά το όριο χωρητικότητας, που θα μας επιτρέψει να προσφέρουμε μια ασφαλή και ευχάριστη παραμονή στο χώρο μας».